研究院下设采矿研究所、选矿与湿法冶金研究所、质量与标准测试研究所，建有28个试验研究室。目前，拥有MicroMine、Dimine数字矿山软件系统、高精度矿物解离分析系统、高倍光电显微镜等现代化矿山研究试验软、硬件平台。
选矿试验研究
依托完备的浮选、磁选、重选等小试和连续扩大试验手段，围绕资源的高效开发与综合利用，重点研究：
1、“贫、细、杂”矿物资源的综合回收技术；
2、复杂难选多金属共生矿物分选技术；
3、电化学浮选新工艺；
4、低品位、高含泥、高结合率氧化矿选冶联合工艺试验研究；
5、矿物精加工技术；
6、二次资源综合回收利用技术。
选矿与湿法冶金研究所拥有一支和谐高效、勇于创新的科技队伍，包括云南省技术创新人才1名、云铜集团湿法冶金学科带头人和选矿学科带头人各1名、玉溪矿业公司选矿学科带头人2名、高级工程师4人、工程师4人。具有功能齐全、手段先进的矿石工艺矿物学、浮选、磁选、重选、扩大连选试验及湿法冶金小试和扩大试验等11个试验研究室。
AL204电子天平
高倍光电显微镜
湿法冶金工艺研究
1、提高生产规模的试验研究与攻关；
2、高碱性脉石、高含泥、高结合率氧化矿和混合矿的浸出技术研究；
3、萃取和净化浓缩工艺的优化控制和装备开发；
4、浸矿微生物学研究及菌种改良；
5、生物浸矿过程基础理论研究；
6、高杂质、低品位精矿的浸出技术研究；
7、伴生金属综合回收试验研究。
先进的高精度磁选机
ICPS-1000IV 发射光谱仪
质量与标准测试所
质量与标准测试所主要开展化验分析和计量检定/校准业务，下设分析中心和计量室。
分析中心
分析中心是通过云南省技术监督局认证的省级计量认证合格单位，且历次复审合格，可为社会提供公证分析数据。
分析中心拥有岛津ICP顺序型电感耦合等离子体发射光谱仪、红外分光光度计、原子吸收分光光度计等大中型分析仪器。现有高级工程师2人，工程师2人，助理工程师2人。业务范围包括地质勘查、采矿、选矿、冶炼过程中样品化学分析、仪器分析和水质、粉尘等环境监测分析。
